Τώρα υπάρχουν δύο εμβόλια έναντι του ιού HPV. Ο εμβολιασμός μπορεί να προστατεύσει από τον καρκίνο  του τραχήλου της μήτρας που οφείλεται στους τύπους 16 και 18 του HPV, οι οποίοι ευθύνονται για πάνω από το 70% των περιπτώσεων καρκίνου του τραχήλου της μήτρας. Ο εμβολιασμός δεν προστατεύει έναντι όλων των ογκογόνων τύπων, γι΄αυτό και ο περιοδικός προσυμπτωματικός έλεγχος με την εξέταση κατά Παπανικολάου παραμένει ιδιαίτερα σημαντικός. 
Η ασφαλής σεξουαλική επαφή είναι πάντα σημαντική. Το προφυλακτικό αποτελεί ένα συνετό προληπτικό μέτρο έναντι των σεξουαλικά μεταδιδόμενων νοσημάτων που περιλαμβάνουν και την μείωση του κινδύνου λοίμωξης από HPV. 
Το κάπνισμα αυξάνει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Ωστόσο, μπορεί επίσης να αυξήσει τον κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου του τραχήλου της μήτρας.